YOT:n päättävä elin on hallitus. Käytännön toiminta - kaikkein tärkein toiminta - tapahtuu osastoissa. Osastoja on seitsemän.  Alueen osastoon kuuluvat alueilla työssä olevat yleläiset, Pasilassa on neljä suomenkielistä osastoa:  Luovat osasto, Media osasto, Ruutin osasto ja Tuottis osasto. Mediapoliksessa Tampereella töissä olevat ovat pääosin Tohlopin osaston jäseniä ja koko ruotsinkielinen toiminta on oman osastonsa (SFA:n) alla.  Jäsenyys osastoissa tulee automaattisesti oman työpaikan mukaan.